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我校石榴研究团队在国际植物学权威期刊发表封面文章
- 时间:2024-04-21 来源:博鱼app下载官网 人气:
本文摘要:近日,国际园艺学不会石榴工作组主席、我校苑兆和教授领衔的研究团队,经过不懈努力顺利破解石榴仅有基因组,并装配出有高质量基因组草图。涉及研究成果于6月14日作为封面文章月刊登于国际植物学科权威期刊Plant Biotechnology Journal(IF=7.443),标志着我校科研团队在该领域研究中超过国际领先水平。我校苑兆和教授、方炎明教授、张太奎博士,美国康奈尔大学费章君教授,北京百迈克公司韩凤鸣博士为本文联合第一作者,苑兆和教授和方炎清教授为联合通讯作者。
近日,国际园艺学不会石榴工作组主席、我校苑兆和教授领衔的研究团队,经过不懈努力顺利破解石榴仅有基因组,并装配出有高质量基因组草图。涉及研究成果于6月14日作为封面文章月刊登于国际植物学科权威期刊Plant Biotechnology Journal(IF=7.443),标志着我校科研团队在该领域研究中超过国际领先水平。我校苑兆和教授、方炎明教授、张太奎博士,美国康奈尔大学费章君教授,北京百迈克公司韩凤鸣博士为本文联合第一作者,苑兆和教授和方炎清教授为联合通讯作者。该研究首次从组学角度奠定了石榴分类学地位,系统阐述了石榴基因组反复序列的演化和功能,融合mRNA组学分析阐述了石榴浆果品质构成机理和胚珠发育生物学等科学问题,为石榴遗传与选育研究获取参照基因组资源。
期刊封面 石榴基因组大约为336Mb,装配大小为274 Mb,反复序列比例高达51.2%,共计预测出30903条基因。之前学界仍然指出石榴科归属于石榴科,苑兆和教授领衔的研究团队首次通过较为基因组分析,从分子层面奠定了石榴分类学地位,反对石榴科划入为千屈菜科。通过古代基因组学研究,找到石榴与近缘物种巨桉共计一次古代四倍化事件和双子叶植物共计的古六倍化事件,为演化基因组研究获取了参照基因组资源。石榴反复序列中大型逆转录转座子衍生物家族近期再次发生大规模种系特异性拷贝,并与浆果发育过程中的着色和胚珠发育等功能性状涉及。
高质量石榴参照基因组的破解将增进石榴遗传改进研究,为普遍的植物较为与演化基因组研究以及对独有浆果品质构成机理研究获取基因组资源。石榴是一古老树种,集生态、经济和社会效益,以及观赏价值与保健等功能于一体,其浆果含有福石榴苷等鞣花丹宁类抗氧化活性物质,被誉为超级水果、保健水果。近年来,石榴作为新兴果树在中国、印度、伊朗、美国、西班牙、以色列、土耳其、意大利、俄罗斯、南非、智利等国家普遍栽培,发展势头快速增长,也是国家规划特色经济林树种之一。
此次苑兆和教授团队的研究成果对石榴浆果品质改进和国际石榴产业发展将产生深远影响。石榴基因组反复序列LARD家族演化与传达该研究获得了国家自然科学基金、江苏省高校优势学科建设工程项目、南京林业大学高层次人才科研启动基金项目、江苏省普通高校研究生科研创意计划项目、南京林业大学杰出博士学位论文创意基金项目以及美国国家科学基金项目的资助。
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